Protein–RNA interactions for Protein: A6NJR5

Putative speedy protein-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NJR5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A6NJR5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A6NJR5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A6NJR5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A6NJR5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A6NJR5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
A6NJR5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
A6NJR5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
A6NJR5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A6NJR5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A6NJR5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A6NJR5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A6NJR5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A6NJR5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A6NJR5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A6NJR5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A6NJR5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A6NJR5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A6NJR5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
A6NJR5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
A6NJR5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A6NJR5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A6NJR5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A6NJR5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A6NJR5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A6NJR5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A6NJR5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
A6NJR5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A6NJR5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A6NJR5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A6NJR5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A6NJR5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
A6NJR5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A6NJR5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A6NJR5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
A6NJR5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
A6NJR5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
A6NJR5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A6NJR5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
A6NJR5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A6NJR5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A6NJR5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
A6NJR5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
A6NJR5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
A6NJR5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
A6NJR5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
A6NJR5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
A6NJR5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A6NJR5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
A6NJR5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
A6NJR5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A6NJR5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A6NJR5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A6NJR5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
A6NJR5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A6NJR5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A6NJR5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A6NJR5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A6NJR5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A6NJR5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A6NJR5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A6NJR5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A6NJR5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
A6NJR5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A6NJR5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A6NJR5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A6NJR5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
A6NJR5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
A6NJR5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A6NJR5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A6NJR5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
A6NJR5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A6NJR5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A6NJR5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A6NJR5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
A6NJR5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A6NJR5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
A6NJR5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
A6NJR5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
A6NJR5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
A6NJR5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A6NJR5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A6NJR5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
A6NJR5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A6NJR5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
A6NJR5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
A6NJR5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
A6NJR5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
A6NJR5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A6NJR5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A6NJR5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
A6NJR5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
A6NJR5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A6NJR5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
A6NJR5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
A6NJR5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
A6NJR5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
A6NJR5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
A6NJR5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
A6NJR5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms