Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBY3A6NI87 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBY3A6NI87 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CBY3A6NI87 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBY3A6NI87 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBY3A6NI87 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBY3A6NI87 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBY3A6NI87 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBY3A6NI87 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBY3A6NI87 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBY3A6NI87 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBY3A6NI87 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBY3A6NI87 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBY3A6NI87 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBY3A6NI87 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBY3A6NI87 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBY3A6NI87 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBY3A6NI87 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CBY3A6NI87 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms