Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC69A6NI79 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC69A6NI79 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.1 ms