Protein–RNA interactions for Protein: A6NHJ4

ZNF860, Zinc finger protein 860, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF860A6NHJ4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF860A6NHJ4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF860A6NHJ4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF860A6NHJ4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF860A6NHJ4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF860A6NHJ4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF860A6NHJ4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF860A6NHJ4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF860A6NHJ4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF860A6NHJ4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF860A6NHJ4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF860A6NHJ4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF860A6NHJ4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF860A6NHJ4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF860A6NHJ4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF860A6NHJ4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF860A6NHJ4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF860A6NHJ4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF860A6NHJ4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF860A6NHJ4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF860A6NHJ4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF860A6NHJ4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms