Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTAGE9A4FU28 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTAGE9A4FU28 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms