Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMX2A2RU54 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMX2A2RU54 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMX2A2RU54 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMX2A2RU54 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMX2A2RU54 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMX2A2RU54 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMX2A2RU54 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HMX2A2RU54 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMX2A2RU54 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMX2A2RU54 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HMX2A2RU54 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HMX2A2RU54 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMX2A2RU54 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms