Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQ27

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQ27 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A1W2PQ27 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.57■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.56■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.55■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
A0A1W2PQ27 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
A0A1W2PQ27 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A1W2PQ27 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A1W2PQ27 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1W2PQ27 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1W2PQ27 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1W2PQ27 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms