Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV5-3A0A0A0MS03 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBV5-3A0A0A0MS03 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBV5-3A0A0A0MS03 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBV5-3A0A0A0MS03 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBV5-3A0A0A0MS03 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBV5-3A0A0A0MS03 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBV5-3A0A0A0MS03 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBV5-3A0A0A0MS03 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBV5-3A0A0A0MS03 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBV5-3A0A0A0MS03 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBV5-3A0A0A0MS03 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBV5-3A0A0A0MS03 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBV5-3A0A0A0MS03 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV5-3A0A0A0MS03 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV5-3A0A0A0MS03 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBV5-3A0A0A0MS03 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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