Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WXM4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WXM4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
A0A087WXM4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms