Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
V9GYQ6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
V9GYQ6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
V9GYQ6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
V9GYQ6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
V9GYQ6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
V9GYQ6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
V9GYQ6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
V9GYQ6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
V9GYQ6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
V9GYQ6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
V9GYQ6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
V9GYQ6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
V9GYQ6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
V9GYQ6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
V9GYQ6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYQ6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYQ6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYQ6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYQ6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYQ6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYQ6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYQ6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYQ6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYQ6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYQ6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYQ6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYQ6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYQ6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYQ6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYQ6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYQ6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYQ6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYQ6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
V9GYQ6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
V9GYQ6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
V9GYQ6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
V9GYQ6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
V9GYQ6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
V9GYQ6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
V9GYQ6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
V9GYQ6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
V9GYQ6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
V9GYQ6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
V9GYQ6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
V9GYQ6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
V9GYQ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
V9GYQ6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
V9GYQ6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
V9GYQ6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
V9GYQ6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
V9GYQ6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
V9GYQ6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
V9GYQ6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
V9GYQ6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
V9GYQ6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
V9GYQ6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
V9GYQ6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
V9GYQ6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
V9GYQ6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
V9GYQ6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
V9GYQ6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
V9GYQ6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
V9GYQ6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
V9GYQ6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
V9GYQ6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
V9GYQ6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
V9GYQ6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
V9GYQ6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
V9GYQ6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
V9GYQ6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
V9GYQ6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
V9GYQ6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
V9GYQ6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
V9GYQ6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
V9GYQ6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
V9GYQ6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
V9GYQ6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
V9GYQ6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
V9GYQ6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
V9GYQ6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
V9GYQ6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
V9GYQ6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
V9GYQ6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
V9GYQ6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
V9GYQ6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
V9GYQ6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
V9GYQ6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
V9GYQ6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
V9GYQ6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
V9GYQ6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
V9GYQ6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
V9GYQ6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
V9GYQ6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
V9GYQ6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
V9GYQ6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
V9GYQ6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
V9GYQ6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
V9GYQ6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
V9GYQ6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms