Protein–RNA interactions for Protein: R4GMX3

COMMD3-BMI1, COMMD3-BMI1 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3-BMI1R4GMX3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD3-BMI1R4GMX3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD3-BMI1R4GMX3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD3-BMI1R4GMX3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms