Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G2

PCDHGB2, Protocadherin gamma-B2, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB2Q9Y5G2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHGB2Q9Y5G2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHGB2Q9Y5G2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHGB2Q9Y5G2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.7 ms