Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRP12Q9Y561 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRP12Q9Y561 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRP12Q9Y561 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP12Q9Y561 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms