Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NOP58Q9Y2X3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NOP58Q9Y2X3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NOP58Q9Y2X3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
NOP58Q9Y2X3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NOP58Q9Y2X3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NOP58Q9Y2X3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NOP58Q9Y2X3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NOP58Q9Y2X3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NOP58Q9Y2X3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NOP58Q9Y2X3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NOP58Q9Y2X3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NOP58Q9Y2X3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NOP58Q9Y2X3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NOP58Q9Y2X3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NOP58Q9Y2X3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NOP58Q9Y2X3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NOP58Q9Y2X3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NOP58Q9Y2X3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NOP58Q9Y2X3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NOP58Q9Y2X3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms