Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DTX4Q9Y2E6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTX4Q9Y2E6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms