Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCML1Q9UN30 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML1Q9UN30 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML1Q9UN30 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCML1Q9UN30 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms