Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNOT11Q9UKZ1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT11Q9UKZ1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms