Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ADAM28Q9UKQ2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ADAM28Q9UKQ2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ADAM28Q9UKQ2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ADAM28Q9UKQ2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms