Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ASIC3Q9UHC3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ASIC3Q9UHC3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms