Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AFF4Q9UHB7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AFF4Q9UHB7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms