Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUX4Q9UBX2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUX4Q9UBX2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUX4Q9UBX2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUX4Q9UBX2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUX4Q9UBX2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUX4Q9UBX2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUX4Q9UBX2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUX4Q9UBX2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUX4Q9UBX2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUX4Q9UBX2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DUX4Q9UBX2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUX4Q9UBX2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUX4Q9UBX2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUX4Q9UBX2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUX4Q9UBX2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUX4Q9UBX2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUX4Q9UBX2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUX4Q9UBX2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DUX4Q9UBX2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DUX4Q9UBX2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUX4Q9UBX2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUX4Q9UBX2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUX4Q9UBX2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUX4Q9UBX2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms