Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GSKIPQ9P0R6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSKIPQ9P0R6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSKIPQ9P0R6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSKIPQ9P0R6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSKIPQ9P0R6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSKIPQ9P0R6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSKIPQ9P0R6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GSKIPQ9P0R6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSKIPQ9P0R6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSKIPQ9P0R6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSKIPQ9P0R6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSKIPQ9P0R6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSKIPQ9P0R6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSKIPQ9P0R6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GSKIPQ9P0R6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSKIPQ9P0R6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GSKIPQ9P0R6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSKIPQ9P0R6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSKIPQ9P0R6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSKIPQ9P0R6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
GSKIPQ9P0R6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GSKIPQ9P0R6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSKIPQ9P0R6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms