Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LMCD1Q9NZU5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMCD1Q9NZU5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMCD1Q9NZU5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMCD1Q9NZU5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMCD1Q9NZU5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMCD1Q9NZU5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMCD1Q9NZU5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMCD1Q9NZU5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMCD1Q9NZU5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMCD1Q9NZU5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMCD1Q9NZU5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMCD1Q9NZU5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMCD1Q9NZU5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMCD1Q9NZU5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMCD1Q9NZU5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMCD1Q9NZU5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMCD1Q9NZU5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMCD1Q9NZU5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMCD1Q9NZU5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LMCD1Q9NZU5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMCD1Q9NZU5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LMCD1Q9NZU5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMCD1Q9NZU5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMCD1Q9NZU5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMCD1Q9NZU5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms