Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2orf42Q9NWW7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C2orf42Q9NWW7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C2orf42Q9NWW7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2orf42Q9NWW7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms