Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCM2LQ9NUG4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCM2LQ9NUG4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms