Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
PDS5BQ9NTI5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
PDS5BQ9NTI5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
PDS5BQ9NTI5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
PDS5BQ9NTI5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
PDS5BQ9NTI5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
PDS5BQ9NTI5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
PDS5BQ9NTI5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
PDS5BQ9NTI5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
PDS5BQ9NTI5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC43.21■■■■■ 4.51
PDS5BQ9NTI5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
PDS5BQ9NTI5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
PDS5BQ9NTI5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
PDS5BQ9NTI5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC43.2■■■■■ 4.51
PDS5BQ9NTI5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
PDS5BQ9NTI5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.5
PDS5BQ9NTI5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
PDS5BQ9NTI5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
PDS5BQ9NTI5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
PDS5BQ9NTI5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
PDS5BQ9NTI5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC43.17■■■■■ 4.5
PDS5BQ9NTI5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
PDS5BQ9NTI5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
PDS5BQ9NTI5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
PDS5BQ9NTI5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
PDS5BQ9NTI5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
PDS5BQ9NTI5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
PDS5BQ9NTI5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
PDS5BQ9NTI5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
PDS5BQ9NTI5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
PDS5BQ9NTI5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
PDS5BQ9NTI5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
PDS5BQ9NTI5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC43.13■■■■■ 4.49
PDS5BQ9NTI5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
PDS5BQ9NTI5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
PDS5BQ9NTI5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
PDS5BQ9NTI5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
PDS5BQ9NTI5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
PDS5BQ9NTI5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
PDS5BQ9NTI5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
PDS5BQ9NTI5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
PDS5BQ9NTI5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
PDS5BQ9NTI5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
PDS5BQ9NTI5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
PDS5BQ9NTI5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
PDS5BQ9NTI5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
PDS5BQ9NTI5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
PDS5BQ9NTI5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
PDS5BQ9NTI5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
PDS5BQ9NTI5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.05■■■■■ 4.48
PDS5BQ9NTI5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC43.05■■■■■ 4.48
PDS5BQ9NTI5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
PDS5BQ9NTI5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
PDS5BQ9NTI5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
PDS5BQ9NTI5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
PDS5BQ9NTI5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC43.04■■■■■ 4.48
PDS5BQ9NTI5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
PDS5BQ9NTI5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
PDS5BQ9NTI5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
PDS5BQ9NTI5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
PDS5BQ9NTI5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
PDS5BQ9NTI5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
PDS5BQ9NTI5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
PDS5BQ9NTI5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
PDS5BQ9NTI5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
PDS5BQ9NTI5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
PDS5BQ9NTI5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
PDS5BQ9NTI5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC43■■■■■ 4.47
PDS5BQ9NTI5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
PDS5BQ9NTI5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
PDS5BQ9NTI5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
PDS5BQ9NTI5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
PDS5BQ9NTI5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
PDS5BQ9NTI5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
PDS5BQ9NTI5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
PDS5BQ9NTI5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
PDS5BQ9NTI5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
PDS5BQ9NTI5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC42.93■■■■■ 4.46
PDS5BQ9NTI5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
PDS5BQ9NTI5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
PDS5BQ9NTI5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
PDS5BQ9NTI5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
PDS5BQ9NTI5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
PDS5BQ9NTI5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
PDS5BQ9NTI5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
PDS5BQ9NTI5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
PDS5BQ9NTI5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
PDS5BQ9NTI5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
PDS5BQ9NTI5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
PDS5BQ9NTI5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
PDS5BQ9NTI5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
PDS5BQ9NTI5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
PDS5BQ9NTI5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.45
PDS5BQ9NTI5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
PDS5BQ9NTI5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
PDS5BQ9NTI5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC42.86■■■■■ 4.45
PDS5BQ9NTI5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
PDS5BQ9NTI5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
PDS5BQ9NTI5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC42.86■■■■■ 4.45
PDS5BQ9NTI5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC42.85■■■■■ 4.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms