Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATG3Q9NT62 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATG3Q9NT62 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATG3Q9NT62 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATG3Q9NT62 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATG3Q9NT62 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATG3Q9NT62 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATG3Q9NT62 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATG3Q9NT62 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATG3Q9NT62 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
ATG3Q9NT62 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ATG3Q9NT62 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ATG3Q9NT62 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ATG3Q9NT62 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ATG3Q9NT62 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ATG3Q9NT62 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
ATG3Q9NT62 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ATG3Q9NT62 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ATG3Q9NT62 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ATG3Q9NT62 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
ATG3Q9NT62 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
ATG3Q9NT62 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
ATG3Q9NT62 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ATG3Q9NT62 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
ATG3Q9NT62 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ATG3Q9NT62 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ATG3Q9NT62 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ATG3Q9NT62 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ATG3Q9NT62 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ATG3Q9NT62 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ATG3Q9NT62 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ATG3Q9NT62 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ATG3Q9NT62 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ATG3Q9NT62 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
ATG3Q9NT62 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ATG3Q9NT62 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ATG3Q9NT62 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ATG3Q9NT62 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ATG3Q9NT62 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ATG3Q9NT62 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ATG3Q9NT62 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ATG3Q9NT62 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ATG3Q9NT62 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ATG3Q9NT62 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ATG3Q9NT62 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ATG3Q9NT62 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ATG3Q9NT62 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
ATG3Q9NT62 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ATG3Q9NT62 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms