Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD2Q9NRG4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms