Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM8Q9NQV8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRDM8Q9NQV8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms