Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPS4Q9NQG7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS4Q9NQG7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms