Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCB6Q9NP58 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCB6Q9NP58 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCB6Q9NP58 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms