Protein–RNA interactions for Protein: Q9H987

SYNPO2L, Synaptopodin 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2LQ9H987 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2LQ9H987 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPO2LQ9H987 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNPO2LQ9H987 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2LQ9H987 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2LQ9H987 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2LQ9H987 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2LQ9H987 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2LQ9H987 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2LQ9H987 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2LQ9H987 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2LQ9H987 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2LQ9H987 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2LQ9H987 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms