Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP3Q9H6T3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP3Q9H6T3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPAP3Q9H6T3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms