Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3R5

CENPH, Centromere protein H, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPHQ9H3R5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPHQ9H3R5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CENPHQ9H3R5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPHQ9H3R5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms