Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM9Q9C026 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM9Q9C026 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM9Q9C026 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM9Q9C026 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM9Q9C026 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM9Q9C026 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM9Q9C026 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM9Q9C026 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM9Q9C026 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM9Q9C026 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM9Q9C026 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM9Q9C026 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM9Q9C026 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM9Q9C026 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM9Q9C026 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM9Q9C026 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM9Q9C026 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM9Q9C026 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM9Q9C026 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM9Q9C026 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms