Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UPF3BQ9BZI7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UPF3BQ9BZI7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms