Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC2P3Q9BVR0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HERC2P3Q9BVR0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERC2P3Q9BVR0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC2P3Q9BVR0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms