Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf50Q9BV19 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf50Q9BV19 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 504 ms