Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF4Q9BUZ4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms