Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR0

ZKSCAN3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3Q9BRR0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZKSCAN3Q9BRR0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZKSCAN3Q9BRR0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZKSCAN3Q9BRR0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZKSCAN3Q9BRR0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ZKSCAN3Q9BRR0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZKSCAN3Q9BRR0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZKSCAN3Q9BRR0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZKSCAN3Q9BRR0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZKSCAN3Q9BRR0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZKSCAN3Q9BRR0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms