Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SH2D3AQ9BRG2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SH2D3AQ9BRG2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SH2D3AQ9BRG2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SH2D3AQ9BRG2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SH2D3AQ9BRG2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH2D3AQ9BRG2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SH2D3AQ9BRG2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH2D3AQ9BRG2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SH2D3AQ9BRG2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SH2D3AQ9BRG2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SH2D3AQ9BRG2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SH2D3AQ9BRG2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH2D3AQ9BRG2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH2D3AQ9BRG2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH2D3AQ9BRG2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms