Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE4

SELENOS, Selenoprotein S, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOSQ9BQE4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SELENOSQ9BQE4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SELENOSQ9BQE4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SELENOSQ9BQE4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SELENOSQ9BQE4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELENOSQ9BQE4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELENOSQ9BQE4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELENOSQ9BQE4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELENOSQ9BQE4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SELENOSQ9BQE4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SELENOSQ9BQE4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SELENOSQ9BQE4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SELENOSQ9BQE4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SELENOSQ9BQE4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SELENOSQ9BQE4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SELENOSQ9BQE4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELENOSQ9BQE4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELENOSQ9BQE4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELENOSQ9BQE4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELENOSQ9BQE4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELENOSQ9BQE4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELENOSQ9BQE4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELENOSQ9BQE4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELENOSQ9BQE4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SELENOSQ9BQE4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms