Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABRG3Q99928 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABRG3Q99928 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABRG3Q99928 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABRG3Q99928 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABRG3Q99928 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRG3Q99928 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRG3Q99928 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms