Protein–RNA interactions for Protein: Q99767

APBA2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA2Q99767 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APBA2Q99767 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APBA2Q99767 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APBA2Q99767 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APBA2Q99767 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APBA2Q99767 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
APBA2Q99767 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
APBA2Q99767 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBA2Q99767 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBA2Q99767 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBA2Q99767 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APBA2Q99767 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APBA2Q99767 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APBA2Q99767 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APBA2Q99767 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA2Q99767 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA2Q99767 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA2Q99767 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA2Q99767 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA2Q99767 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA2Q99767 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA2Q99767 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA2Q99767 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
APBA2Q99767 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
APBA2Q99767 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
APBA2Q99767 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
APBA2Q99767 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APBA2Q99767 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
APBA2Q99767 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APBA2Q99767 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBA2Q99767 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBA2Q99767 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBA2Q99767 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBA2Q99767 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBA2Q99767 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBA2Q99767 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBA2Q99767 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBA2Q99767 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBA2Q99767 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBA2Q99767 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBA2Q99767 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBA2Q99767 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBA2Q99767 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBA2Q99767 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms