Protein–RNA interactions for Protein: Q99748

NRTN, Neurturin, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRTNQ99748 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NRTNQ99748 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRTNQ99748 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRTNQ99748 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRTNQ99748 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms