Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD5Q99717 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD5Q99717 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms