Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK4

BBS4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS4Q96RK4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS4Q96RK4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS4Q96RK4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS4Q96RK4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS4Q96RK4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS4Q96RK4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS4Q96RK4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS4Q96RK4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS4Q96RK4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS4Q96RK4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS4Q96RK4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS4Q96RK4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS4Q96RK4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS4Q96RK4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS4Q96RK4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS4Q96RK4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BBS4Q96RK4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBS4Q96RK4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS4Q96RK4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 329.2 ms