Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC85AQ96PX6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC85AQ96PX6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC85AQ96PX6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC85AQ96PX6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC85AQ96PX6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC85AQ96PX6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC85AQ96PX6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC85AQ96PX6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC85AQ96PX6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC85AQ96PX6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC85AQ96PX6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC85AQ96PX6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC85AQ96PX6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC85AQ96PX6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC85AQ96PX6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC85AQ96PX6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC85AQ96PX6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC85AQ96PX6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC85AQ96PX6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC85AQ96PX6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC85AQ96PX6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC85AQ96PX6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC85AQ96PX6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC85AQ96PX6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms