Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2E2Q96LR5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2E2Q96LR5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2E2Q96LR5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2E2Q96LR5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2E2Q96LR5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2E2Q96LR5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2E2Q96LR5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2E2Q96LR5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2E2Q96LR5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2E2Q96LR5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2E2Q96LR5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2E2Q96LR5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2E2Q96LR5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2E2Q96LR5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2E2Q96LR5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2E2Q96LR5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2E2Q96LR5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2E2Q96LR5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2E2Q96LR5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2E2Q96LR5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2E2Q96LR5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2E2Q96LR5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2E2Q96LR5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms