Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPZA3Q96KX2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPZA3Q96KX2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPZA3Q96KX2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms